Uğur Gürel
Serbest Muhasebeci Mali Müşavir
Altınbaş Üniversitesi
Mali İşler, Bütçe ve Satın Alma Daire Başkanı
ugur.gurel@altinbas.edu.tr

Yükseköğretim Kanununda Önemli Değişiklik

17.04.2026 tarihli Resmî Gazete’ de yayınlanan “7577 Bazı Kanunlarda Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun” ile Vakıf Yükseköğretim Kurumlarını etkileyen iki köklü değişiklik olmuştur. Bu değişiklikleri iki ana başlık altında inceleyebiliriz:

A) Kurumlar Vergisi Yönünden

17.04.2026 tarihli Resmî Gazetede “7577 Bazı Kanunlarda Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun” başlığı altında yayınlanan 2. Madde’ ye göre;

 4/11/1981 tarihli ve 2547 sayılı Yükseköğretim Kanununun ek 7 nci maddesinin birinci fıkrasında yer alan “kurumları” ibaresinden sonra gelmek üzere “(13/6/2006 tarihli ve 5520 sayılı Kurumlar Vergisi Kanununun 4’üncü maddesinin birinci fıkrasının (b) bendi kapsamındaki muafiyet hükmü hariç)” ibaresi eklenmiştir.

2547 sayılı Yükseköğretim Kanununun 56. Maddesinde Yükseköğretim Kurumları’na sağlanan mali kolaylıklar belirtilmiştir. Aynı kanunun EK-7. Maddesinde ise “Vakıflarca kurulacak yükseköğretim kurumları, bu Kanunun 56’ncı maddesinde yer alan mali kolaylıklardan, muafiyetlerden ve istisnalardan aynen istifade ederler ve bunlar emlak vergisinden muaf tutulurlar.” denilmektedir.

5520 Sayılı Kurumlar Vergisi Kanunu 4. Maddesi birinci fıkrasının (b) bendinde ise;

“Kamu idare ve kuruluşları tarafından genel insan ve hayvan sağlığını korumak ve tedavi amacıyla işletilen hastane, klinik, dispanser, sanatoryum, huzurevi, çocuk bakımevi, hayvan hastanesi ve dispanseri, hayvan bakımevi, veteriner bakteriyoloji, seroloji, distofajin kuruluşları ve benzeri kuruluşlar.(6009 sayılı Kanunun 43 üncü maddesiyle eklenen cümle Yürürlük; 01.08.2010)(Bunlardan sağlık hizmeti sunanların teşhis ve tedaviye yönelik olarak birbirlerine yapacakları (6225 sayılı Kanunun 7 inci maddesiyle değişen ibare Yürürlük; 26.04.2011)mal ve hizmet satışları ile Sağlık Bakanlığına bağlı hastane, klinik, dispanser, sanatoryum gibi kurum ve kuruluşların yapacağı Gelir Vergisi Kanununun 70 inci maddesinde belirtilen mal ve hakların kiralanması işlemleri(*) bu muafiyeti ortadan kaldırmaz.)” denilmişti.

17.04.2026 tarihinde yayınlanan Resmî Gazete de 2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu EK-7. Maddesine eklenen ve yukarıda 5520 sayılı Kurumlar Vergisi Kanunu 4.madde birinci fıkrasının b bendinin hariç tutulması ile Vakıf Üniversiteleri tarafından işletilen Ağız ve Diş Sağlığı Araştırma Uygulama Merkezleri, Sağlık Araştırma Uygulama Merkezleri, Klinikler ve niteliği bu kapsamda olan işletmelerin değişikliğin yürürlük tarihi olan 01.01.2027 tarihinden itibaren Kurumlar Vergisine tabi olacaktır.

Köklü bir değişiklik yapılan bu konuyla ilgili açık olmayan kısımlarda bulunmaktadır. Örneğin, Üniversite kadrolarında yer alan akademisyenlerin kliniklerde verdiği hizmetin nasıl değerlendirileceği ve yansıtma yapılacaksa hangi usul ve esaslarla yapılacağı, indirilebilecek veya indirilemeyecek özellikli giderlerin belirlenmesi gibi konularda idarenin açıklamalarına ihtiyaç duyulmaktadır. Bunlar muhtemelen özelge talepleri ile idareye gidecektir ancak uzun yıllar aynı kalmış, denetimi sınırlı ve çok geniş bir kapsamı olacak olan bu konuda gerekli düzenlemelerin bir an önce yapılması ilgili kurumların uyum sürecini kolaylaştıracaktır.

B. Katma Değer Vergisi Yönünden

17.04.2026 tarihli Resmî Gazetede “7577 Bazı Kanunlarda Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun” başlığı altında yayınlanan 3. Madde de ise şu şekilde belirtilmiştir:

25/10/1984 tarihli ve 3065 sayılı Katma Değer Vergisi Kanununun 17’nci maddesinin (2) numaralı fıkrasının (a) bendinde yer alan “gibi kuruluşlar” ibaresinden sonra gelmek üzere “(Cumhurbaşkanınca vergi muafiyeti tanınan vakıflarca kurulan yükseköğretim kurumları tarafından işletilenler hariç)” ibaresi ve (4) numaralı fıkrasının (g) bendinden sonra gelmek üzere aşağıdaki bent eklenmiştir.

“ğ) 4/11/1983 tarihli ve 2942 sayılı Kamulaştırma Kanunu kapsamında taşınmazların kamulaştırmayı yapan Devlet ve kamu tüzel kişilerine devri,”

3065 sayılı KDV Kanunu 17/2 (a) maddesi “Sosyal Amaçlı İstisnaları” düzenlemiştir. Bu maddeye göre: Yukarıda sayılan kurum ve kuruluşların hastane, nekahathane, klinik, dispanser, prevantoryum, sanatoryum, kan bankası ve organ nakline mahsus bankalar, anıtlar, botanik ve zooloji bahçeleri, parklar ile veteriner, bakteriyoloji, seroloji ve distofajin laboratuvarları gibi kuruluşlar, öğrenci veya yetiştirme yurtları, yaşlı ve engelli bakım ve huzurevleri, parasız fukara aşevleri, düşkünevleri ve yetimhaneleri işletmek veya yönetmek suretiyle ifa ettikleri kuruluş amaçlarına uygun teslim ve hizmetleri ile bunlardan sağlık hizmeti sunanların teşhis ve tedaviye yönelik olarak birbirlerine yapacakları teslim ve hizmetler istisna tutulmuştur.

Kanunda geçen “Yukarıda sayılan kurum ve kuruluşlar” ibaresi ise bir önceki maddede genel ve katma bütçeli daireler, il özel idareleri, belediyeler, köyler, bunların teşkil ettikleri birlikler, üniversiteler, döner sermayeli kuruluşlar, kanunla ve Cumhurbaşkanlığı Kararnamesiyle kurulan kamu kurum ve kuruluşları, kamu kurumu niteliğindeki meslek kuruluşları, siyasî partiler ve sendikalar, kanunla kurulan veya tüzelkişiliği haiz emekli ve yardım sandıkları, kamu menfaatine yararlı dernekler, tarımsal amaçlı kooperatifler ve Cumhurbaşkanınca vergi muafiyeti tanınan vakıflar olarak tanımlanmıştır.

Bu madde içeriğine eklenen “Cumhurbaşkanınca vergi muafiyeti tanınan vakıflarca kurulan yükseköğretim kurumları tarafından işletilenler hariç” ibaresi ile Vakıf Yükseköğretim Kurumları tarafından işletilen Klinik, Sağlık Araştırma Uygulama Merkezleri ve yine yukarıda sayılan bu nitelikteki işletmeler yürürlük tarihi olan 01.01.2027 tarihinden itibaren KDV’ye tabi tutulacaktır.

C. Sonuç

Vakıf Üniversitelerinin sağlık ve araştırma merkezlerinin durumu, hem eğitim-öğretim faaliyetlerinin bir parçası olmaları hem de fiilen gelir getirici hizmet sunmaları sebebiyle karmaşık bir görünüm arz etmektedir. Yapılan bu yasal değişiklik bu tartışmalar açıklık getirmek, özel sağlık kurumları ile rekabet eşitliğini sağlamak, vergisel boyutunu daha açık ve sistematik hale getirmeyi amaçlamaktadır. Bu kapsamda 01.01.2027 tarihinden itibaren -her ne kadar açık hale getirilmesi gereken noktalar olsa bile- özellikle Vakıf Üniversiteleri bünyesinde faaliyet gösteren Ağız ve Diş Sağlığı AUM gibi klinikler iktisadi işletme olarak değerlendirilmek suretiyle kurumlar vergisine, yine bu merkezler tarafından sunulan hizmetler bedel karşılığı gerçekleştiği ölçüde KDV’ye tabi olacağı anlaşılmaktadır.

07.05.2026

Kaynak: www.MuhasebeTR.com
(Bu makale kaynak göstermeden yayınlanamaz. Kaynak gösterilse dahi, makale aktif link verilerek yayınlanabilir. Kaynak göstermeden ve aktif link vermeden yayınlayanlar hakkında yasal işlem yapılacaktır.)

>> Duyurulardan haberdar olmak için E-Posta Listemize kayıt olun.

>> SGK Teşvikleri (150 Sayfa) Ücretsiz E-Kitap: hemen indir.

>> MuhasebeTR mobil uygulamasını Apple Store 'dan hemen indir.

>> MuhasebeTR mobil uygulamasını Google Play 'den hemen indir.

>> YILIN KAMPANYASI: Muhasebecilere Özel Web Sitesi 1.666 TL + KDV  Ayrıntılar için tıklayın.